ไลเกส เอนไซม์เชื่อมต่อโมเลกุลในระบบชีวเคมี
สรุปใจความสำคัญ
- ไลเกสเป็นเอนไซม์ที่สร้างพันธะเคมีใหม่เพื่อเชื่อมต่อโมเลกุลสองโมเลกุลเข้าด้วยกัน
- DNA ligase เป็นตัวอย่างที่สำคัญที่สุดในการซ่อมแซมและสร้างสาย DNA
- ไลเกสถูกจัดอยู่ในกลุ่ม EC 6 ของการจำแนกประเภทเอนไซม์
ในทางชีวเคมี ไลเกส (Ligase) คือเอนไซม์ที่ทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยาการเชื่อมต่อ (Ligation) ของโมเลกุลสองโมเลกุลเข้าด้วยกัน โดยการสร้างพันธะเคมีใหม่ ซึ่งโดยปกติแล้วจะเกิดขึ้นผ่านกระบวนการไฮโดรไลซิส (Hydrolysis) ของกลุ่มเคมีขนาดเล็กที่ติดอยู่กับโมเลกุลใดโมเลกุลหนึ่ง ส่งผลให้เกิดการสร้างพันธะใหม่ เช่น พันธะ C-O, C-S หรือ C-N
การทำงานของไลเกส
ตัวอย่างที่เห็นได้ชัดเจนที่สุดคือ DNA ligase ซึ่งทำหน้าที่เชื่อมต่อชิ้นส่วนของกรดนิวคลีอิกที่เสริมกันสองชิ้นเข้าด้วยกันโดยการสร้างพันธะฟอสโฟไดเอสเทอร์ (Phosphodiester bonds) และช่วยซ่อมแซมรอยขาดของสายเดี่ยวใน DNA สายคู่ที่เกิดขึ้นระหว่างการจำลองตัวเองของ DNA
โดยทั่วไปแล้ว ไลเกสจะเร่งปฏิกิริยาการดึงน้ำออก (Dehydration reaction) เพื่อเชื่อมต่อโมเลกุล A และ B ดังนี้:
A-OH + B-H → A–B + H2O
การเรียกชื่อ (Nomenclature)
การเรียกชื่อของไลเกสมีความหลากหลายและไม่สม่ำเสมอ โดยทั่วไปมักจะมีคำว่า "ไลเกส" อยู่ในชื่อ เช่น DNA ligase ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในห้องปฏิบัติการชีววิทยาโมเลกุล
อย่างไรก็ตาม มีเอนไซม์หลายชนิดที่ใช้คำว่า "ซินเทเทส" (Synthetase) หรือ "ซินเทส" (Synthase) แทน เนื่องจากทำหน้าที่สังเคราะห์โมเลกุลใหม่ นอกจากนี้ยังมีไลเกสบางชนิดที่ใช้ชื่อว่า "คาร์บอกซิเลส" (Carboxylase) เพื่อระบุว่าเอนไซม์นั้นเร่งปฏิกิริยาคาร์บอกซิเลชันโดยเฉพาะ
การจำแนกประเภท (Classification)
ไลเกสถูกจัดอยู่ในกลุ่ม EC 6 ตามการจำแนกประเภทของเอนไซม์ โดยสามารถแบ่งออกเป็น 6 กลุ่มย่อยดังนี้:
| รหัส EC | ประเภทพันธะที่สร้าง | ตัวอย่างเอนไซม์ |
|---|---|---|
| EC 6.1 | พันธะคาร์บอน-ออกซิเจน (C-O) | - |
| EC 6.2 | พันธะคาร์บอน-ซัลเฟอร์ (C-S) | - |
| EC 6.3 | พันธะคาร์บอน-ไนโตรเจน (C-N) | Argininosuccinate synthetase |
| EC 6.4 | พันธะคาร์บอน-คาร์บอน (C-C) | Acetyl-CoA carboxylase |
| EC 6.5 | พันธะฟอสฟอริกเอสเทอร์ (Phosphoric ester) | DNA ligase |
| EC 6.6 | พันธะไนโตรเจน-โลหะ (Nitrogen-metal) | Chelatases |
ไลเกสที่เกี่ยวข้องกับเมมเบรน
ไลเกสบางชนิดมีความสัมพันธ์กับเยื่อหุ้มเซลล์ (Biological membranes) โดยอาจทำหน้าที่เป็นโปรตีนที่เกาะอยู่บริเวณผิวหน้าของเมมเบรน (Peripheral membrane proteins) หรือยึดเกาะผ่านเกลียวทรานส์เมมเบรนเดี่ยว (Single transmembrane helix) เช่น โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับ Ubiquitin ligase
ที่มาของคำศัพท์
คำว่า Ligase มาจากคำผสมระหว่าง lig- (จากภาษาละติน ligāre แปลว่า "ผูก" หรือ "มัดเข้าด้วยกัน") และ -ase (คำลงท้ายที่ระบุว่าเป็นเอนไซม์) ดังนั้นจึงมีความหมายว่า "เอนไซม์ที่ทำหน้าที่ผูกมัดโมเลกุล"
คำถามที่พบบ่อย
ไลเกส (Ligase) ทำหน้าที่อะไร?
ไลเกสทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยาการเชื่อมต่อโมเลกุลสองโมเลกุลเข้าด้วยกันโดยการสร้างพันธะเคมีใหม่ เช่น พันธะ C-O, C-S หรือ C-N
DNA ligase มีความสำคัญอย่างไร?
DNA ligase มีความสำคัญอย่างยิ่งในการเชื่อมต่อชิ้นส่วน DNA และซ่อมแซมรอยขาดของสาย DNA ในระหว่างกระบวนการจำลองตัวเองของ DNA
ความแตกต่างระหว่าง Synthetase และ Synthase คืออะไร?
ในทางชีวเคมี บางครั้งคำสองคำนี้ถูกใช้แทนกันเพื่ออธิบายถึงไลเกส เนื่องจากทั้งคู่ทำหน้าที่ในการสังเคราะห์โมเลกุลใหม่

